一个突然出现在日本某处海上的不明黑色柱状物体开始，Hayakawa博士的孩子们Ai与Yuu，决定去寻找他们失踪的父母们。他们试着从父母亲最初旅行的线索开始找起，之后他们发现父母亲的出发点为异世界的地下铁站，而火车将在12点13分13秒启程前往异世界.
